Protein–RNA interactions for Protein: P35443

THBS4, Thrombospondin-4, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS4P35443 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
THBS4P35443 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
THBS4P35443 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
THBS4P35443 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
THBS4P35443 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
THBS4P35443 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
THBS4P35443 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
THBS4P35443 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
THBS4P35443 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
THBS4P35443 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
THBS4P35443 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
THBS4P35443 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
THBS4P35443 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
THBS4P35443 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
THBS4P35443 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
THBS4P35443 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
THBS4P35443 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
THBS4P35443 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
THBS4P35443 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
THBS4P35443 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
THBS4P35443 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
THBS4P35443 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
THBS4P35443 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
THBS4P35443 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
THBS4P35443 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
THBS4P35443 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
THBS4P35443 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
THBS4P35443 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
THBS4P35443 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
THBS4P35443 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
THBS4P35443 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
THBS4P35443 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
THBS4P35443 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
THBS4P35443 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
THBS4P35443 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
THBS4P35443 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
THBS4P35443 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
THBS4P35443 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
THBS4P35443 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
THBS4P35443 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
THBS4P35443 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
THBS4P35443 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
THBS4P35443 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
THBS4P35443 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
THBS4P35443 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
THBS4P35443 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
THBS4P35443 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
THBS4P35443 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
THBS4P35443 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
THBS4P35443 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
THBS4P35443 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
THBS4P35443 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
THBS4P35443 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
THBS4P35443 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
THBS4P35443 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
THBS4P35443 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
THBS4P35443 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
THBS4P35443 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
THBS4P35443 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
THBS4P35443 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
THBS4P35443 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
THBS4P35443 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
THBS4P35443 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
THBS4P35443 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
THBS4P35443 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
THBS4P35443 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
THBS4P35443 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
THBS4P35443 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
THBS4P35443 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
THBS4P35443 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
THBS4P35443 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
THBS4P35443 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
THBS4P35443 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
THBS4P35443 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
THBS4P35443 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
THBS4P35443 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
THBS4P35443 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
THBS4P35443 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
THBS4P35443 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
THBS4P35443 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
THBS4P35443 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
THBS4P35443 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
THBS4P35443 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
THBS4P35443 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
THBS4P35443 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
THBS4P35443 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
THBS4P35443 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
THBS4P35443 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
THBS4P35443 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
THBS4P35443 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
THBS4P35443 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
THBS4P35443 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
THBS4P35443 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
THBS4P35443 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
THBS4P35443 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
THBS4P35443 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
THBS4P35443 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
THBS4P35443 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
THBS4P35443 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
THBS4P35443 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms