Protein–RNA interactions for Protein: P20749

BCL3, B-cell lymphoma 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL3P20749 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCL3P20749 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCL3P20749 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCL3P20749 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
BCL3P20749 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCL3P20749 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCL3P20749 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCL3P20749 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCL3P20749 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCL3P20749 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCL3P20749 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCL3P20749 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCL3P20749 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCL3P20749 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCL3P20749 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCL3P20749 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BCL3P20749 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BCL3P20749 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BCL3P20749 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BCL3P20749 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BCL3P20749 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BCL3P20749 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BCL3P20749 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BCL3P20749 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BCL3P20749 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BCL3P20749 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BCL3P20749 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BCL3P20749 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BCL3P20749 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BCL3P20749 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BCL3P20749 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BCL3P20749 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BCL3P20749 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BCL3P20749 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
BCL3P20749 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
BCL3P20749 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
BCL3P20749 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BCL3P20749 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BCL3P20749 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BCL3P20749 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BCL3P20749 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BCL3P20749 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BCL3P20749 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
BCL3P20749 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BCL3P20749 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BCL3P20749 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BCL3P20749 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BCL3P20749 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BCL3P20749 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BCL3P20749 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BCL3P20749 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BCL3P20749 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BCL3P20749 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BCL3P20749 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BCL3P20749 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BCL3P20749 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BCL3P20749 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BCL3P20749 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BCL3P20749 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BCL3P20749 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BCL3P20749 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BCL3P20749 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BCL3P20749 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BCL3P20749 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BCL3P20749 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BCL3P20749 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
BCL3P20749 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BCL3P20749 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BCL3P20749 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BCL3P20749 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BCL3P20749 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BCL3P20749 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BCL3P20749 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BCL3P20749 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BCL3P20749 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BCL3P20749 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BCL3P20749 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BCL3P20749 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BCL3P20749 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BCL3P20749 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BCL3P20749 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BCL3P20749 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
BCL3P20749 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BCL3P20749 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BCL3P20749 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BCL3P20749 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BCL3P20749 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BCL3P20749 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BCL3P20749 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BCL3P20749 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BCL3P20749 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BCL3P20749 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BCL3P20749 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BCL3P20749 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BCL3P20749 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BCL3P20749 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BCL3P20749 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BCL3P20749 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BCL3P20749 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BCL3P20749 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms