Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms