Protein–RNA interactions for Protein: P0DP25

CALM3, Calmodulin-3, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALM3P0DP25 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CALM3P0DP25 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CALM3P0DP25 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CALM3P0DP25 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CALM3P0DP25 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CALM3P0DP25 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CALM3P0DP25 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CALM3P0DP25 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALM3P0DP25 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALM3P0DP25 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALM3P0DP25 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALM3P0DP25 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALM3P0DP25 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALM3P0DP25 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALM3P0DP25 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALM3P0DP25 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALM3P0DP25 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALM3P0DP25 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CALM3P0DP25 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALM3P0DP25 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALM3P0DP25 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALM3P0DP25 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALM3P0DP25 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALM3P0DP25 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALM3P0DP25 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALM3P0DP25 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALM3P0DP25 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALM3P0DP25 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALM3P0DP25 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALM3P0DP25 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALM3P0DP25 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALM3P0DP25 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALM3P0DP25 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALM3P0DP25 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALM3P0DP25 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALM3P0DP25 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALM3P0DP25 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALM3P0DP25 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALM3P0DP25 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALM3P0DP25 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALM3P0DP25 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALM3P0DP25 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALM3P0DP25 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALM3P0DP25 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALM3P0DP25 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALM3P0DP25 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALM3P0DP25 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALM3P0DP25 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALM3P0DP25 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALM3P0DP25 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALM3P0DP25 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALM3P0DP25 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALM3P0DP25 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALM3P0DP25 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALM3P0DP25 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALM3P0DP25 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALM3P0DP25 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALM3P0DP25 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALM3P0DP25 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALM3P0DP25 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALM3P0DP25 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALM3P0DP25 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALM3P0DP25 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALM3P0DP25 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALM3P0DP25 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALM3P0DP25 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALM3P0DP25 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALM3P0DP25 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALM3P0DP25 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALM3P0DP25 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALM3P0DP25 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALM3P0DP25 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CALM3P0DP25 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALM3P0DP25 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALM3P0DP25 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALM3P0DP25 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALM3P0DP25 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALM3P0DP25 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALM3P0DP25 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALM3P0DP25 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALM3P0DP25 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALM3P0DP25 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALM3P0DP25 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALM3P0DP25 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALM3P0DP25 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CALM3P0DP25 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALM3P0DP25 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALM3P0DP25 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALM3P0DP25 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALM3P0DP25 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALM3P0DP25 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALM3P0DP25 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALM3P0DP25 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALM3P0DP25 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALM3P0DP25 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALM3P0DP25 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALM3P0DP25 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALM3P0DP25 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALM3P0DP25 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALM3P0DP25 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms