Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms