Protein–RNA interactions for Protein: Q96SD1

DCLRE1C, Protein artemis, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 692 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1CQ96SD1 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DCLRE1CQ96SD1 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DCLRE1CQ96SD1 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DCLRE1CQ96SD1 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DCLRE1CQ96SD1 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DCLRE1CQ96SD1 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DCLRE1CQ96SD1 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DCLRE1CQ96SD1 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DCLRE1CQ96SD1 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DCLRE1CQ96SD1 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DCLRE1CQ96SD1 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DCLRE1CQ96SD1 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DCLRE1CQ96SD1 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DCLRE1CQ96SD1 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DCLRE1CQ96SD1 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
DCLRE1CQ96SD1 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DCLRE1CQ96SD1 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DCLRE1CQ96SD1 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DCLRE1CQ96SD1 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DCLRE1CQ96SD1 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DCLRE1CQ96SD1 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DCLRE1CQ96SD1 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DCLRE1CQ96SD1 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DCLRE1CQ96SD1 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DCLRE1CQ96SD1 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DCLRE1CQ96SD1 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DCLRE1CQ96SD1 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DCLRE1CQ96SD1 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DCLRE1CQ96SD1 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DCLRE1CQ96SD1 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DCLRE1CQ96SD1 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DCLRE1CQ96SD1 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DCLRE1CQ96SD1 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DCLRE1CQ96SD1 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DCLRE1CQ96SD1 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DCLRE1CQ96SD1 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DCLRE1CQ96SD1 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DCLRE1CQ96SD1 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DCLRE1CQ96SD1 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DCLRE1CQ96SD1 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DCLRE1CQ96SD1 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DCLRE1CQ96SD1 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DCLRE1CQ96SD1 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DCLRE1CQ96SD1 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DCLRE1CQ96SD1 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DCLRE1CQ96SD1 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
DCLRE1CQ96SD1 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DCLRE1CQ96SD1 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DCLRE1CQ96SD1 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DCLRE1CQ96SD1 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DCLRE1CQ96SD1 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DCLRE1CQ96SD1 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DCLRE1CQ96SD1 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DCLRE1CQ96SD1 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DCLRE1CQ96SD1 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DCLRE1CQ96SD1 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DCLRE1CQ96SD1 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DCLRE1CQ96SD1 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DCLRE1CQ96SD1 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DCLRE1CQ96SD1 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DCLRE1CQ96SD1 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DCLRE1CQ96SD1 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DCLRE1CQ96SD1 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DCLRE1CQ96SD1 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DCLRE1CQ96SD1 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DCLRE1CQ96SD1 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DCLRE1CQ96SD1 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DCLRE1CQ96SD1 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
DCLRE1CQ96SD1 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DCLRE1CQ96SD1 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
DCLRE1CQ96SD1 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DCLRE1CQ96SD1 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DCLRE1CQ96SD1 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DCLRE1CQ96SD1 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
DCLRE1CQ96SD1 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DCLRE1CQ96SD1 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DCLRE1CQ96SD1 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DCLRE1CQ96SD1 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DCLRE1CQ96SD1 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DCLRE1CQ96SD1 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DCLRE1CQ96SD1 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DCLRE1CQ96SD1 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DCLRE1CQ96SD1 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DCLRE1CQ96SD1 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DCLRE1CQ96SD1 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DCLRE1CQ96SD1 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DCLRE1CQ96SD1 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DCLRE1CQ96SD1 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DCLRE1CQ96SD1 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DCLRE1CQ96SD1 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DCLRE1CQ96SD1 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DCLRE1CQ96SD1 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DCLRE1CQ96SD1 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DCLRE1CQ96SD1 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DCLRE1CQ96SD1 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DCLRE1CQ96SD1 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DCLRE1CQ96SD1 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DCLRE1CQ96SD1 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DCLRE1CQ96SD1 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DCLRE1CQ96SD1 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms