Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms