Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5L3

GDPD3, Lysophospholipase D GDPD3, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD3Q7L5L3 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms