Protein–RNA interactions for Protein: Q29983

MICA, MHC class I polypeptide-related sequence A, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAQ29983 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MICAQ29983 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MICAQ29983 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MICAQ29983 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MICAQ29983 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MICAQ29983 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MICAQ29983 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MICAQ29983 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MICAQ29983 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MICAQ29983 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MICAQ29983 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
MICAQ29983 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MICAQ29983 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
MICAQ29983 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MICAQ29983 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MICAQ29983 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MICAQ29983 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MICAQ29983 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MICAQ29983 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MICAQ29983 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MICAQ29983 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MICAQ29983 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MICAQ29983 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
MICAQ29983 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MICAQ29983 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MICAQ29983 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MICAQ29983 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MICAQ29983 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MICAQ29983 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MICAQ29983 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MICAQ29983 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MICAQ29983 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MICAQ29983 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MICAQ29983 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MICAQ29983 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MICAQ29983 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MICAQ29983 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MICAQ29983 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MICAQ29983 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MICAQ29983 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MICAQ29983 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MICAQ29983 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
MICAQ29983 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MICAQ29983 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MICAQ29983 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MICAQ29983 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MICAQ29983 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MICAQ29983 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MICAQ29983 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MICAQ29983 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MICAQ29983 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MICAQ29983 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MICAQ29983 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MICAQ29983 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MICAQ29983 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MICAQ29983 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MICAQ29983 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MICAQ29983 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MICAQ29983 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MICAQ29983 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MICAQ29983 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MICAQ29983 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MICAQ29983 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MICAQ29983 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MICAQ29983 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MICAQ29983 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
MICAQ29983 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MICAQ29983 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MICAQ29983 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MICAQ29983 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MICAQ29983 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MICAQ29983 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MICAQ29983 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MICAQ29983 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MICAQ29983 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MICAQ29983 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MICAQ29983 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MICAQ29983 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MICAQ29983 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MICAQ29983 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MICAQ29983 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MICAQ29983 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MICAQ29983 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MICAQ29983 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MICAQ29983 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17■□□□□ 0.31
MICAQ29983 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MICAQ29983 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MICAQ29983 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MICAQ29983 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MICAQ29983 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MICAQ29983 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MICAQ29983 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MICAQ29983 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MICAQ29983 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MICAQ29983 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MICAQ29983 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MICAQ29983 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MICAQ29983 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MICAQ29983 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MICAQ29983 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms