Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
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SNCBQ16143 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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SNCBQ16143 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
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SNCBQ16143 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
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SNCBQ16143 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
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SNCBQ16143 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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