Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
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