Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DNASE1L3Q13609 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DNASE1L3Q13609 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DNASE1L3Q13609 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DNASE1L3Q13609 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DNASE1L3Q13609 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DNASE1L3Q13609 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DNASE1L3Q13609 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DNASE1L3Q13609 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DNASE1L3Q13609 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DNASE1L3Q13609 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DNASE1L3Q13609 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DNASE1L3Q13609 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DNASE1L3Q13609 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
DNASE1L3Q13609 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DNASE1L3Q13609 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DNASE1L3Q13609 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DNASE1L3Q13609 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DNASE1L3Q13609 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DNASE1L3Q13609 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
DNASE1L3Q13609 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DNASE1L3Q13609 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DNASE1L3Q13609 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
DNASE1L3Q13609 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DNASE1L3Q13609 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DNASE1L3Q13609 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DNASE1L3Q13609 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
DNASE1L3Q13609 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DNASE1L3Q13609 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DNASE1L3Q13609 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DNASE1L3Q13609 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DNASE1L3Q13609 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DNASE1L3Q13609 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DNASE1L3Q13609 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DNASE1L3Q13609 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DNASE1L3Q13609 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DNASE1L3Q13609 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DNASE1L3Q13609 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DNASE1L3Q13609 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DNASE1L3Q13609 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DNASE1L3Q13609 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
DNASE1L3Q13609 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DNASE1L3Q13609 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DNASE1L3Q13609 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DNASE1L3Q13609 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DNASE1L3Q13609 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DNASE1L3Q13609 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
DNASE1L3Q13609 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DNASE1L3Q13609 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DNASE1L3Q13609 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
DNASE1L3Q13609 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DNASE1L3Q13609 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DNASE1L3Q13609 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DNASE1L3Q13609 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DNASE1L3Q13609 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DNASE1L3Q13609 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DNASE1L3Q13609 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DNASE1L3Q13609 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DNASE1L3Q13609 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DNASE1L3Q13609 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DNASE1L3Q13609 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
DNASE1L3Q13609 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DNASE1L3Q13609 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DNASE1L3Q13609 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DNASE1L3Q13609 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DNASE1L3Q13609 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DNASE1L3Q13609 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DNASE1L3Q13609 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DNASE1L3Q13609 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DNASE1L3Q13609 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DNASE1L3Q13609 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DNASE1L3Q13609 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DNASE1L3Q13609 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
DNASE1L3Q13609 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
DNASE1L3Q13609 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DNASE1L3Q13609 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DNASE1L3Q13609 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
DNASE1L3Q13609 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DNASE1L3Q13609 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DNASE1L3Q13609 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DNASE1L3Q13609 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
DNASE1L3Q13609 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DNASE1L3Q13609 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DNASE1L3Q13609 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DNASE1L3Q13609 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DNASE1L3Q13609 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DNASE1L3Q13609 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DNASE1L3Q13609 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DNASE1L3Q13609 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DNASE1L3Q13609 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DNASE1L3Q13609 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DNASE1L3Q13609 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DNASE1L3Q13609 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DNASE1L3Q13609 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DNASE1L3Q13609 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DNASE1L3Q13609 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DNASE1L3Q13609 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DNASE1L3Q13609 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DNASE1L3Q13609 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DNASE1L3Q13609 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms