Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
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SEMA3BQ13214 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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