Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 CTNND1-223ENST00000529986 5727 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.232e-7■■□□□ 13.8
ILF3Q12906 CTNND1-216ENST00000527467 5071 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.242e-7■■□□□ 13.8
ILF3Q12906 CTNND1-229ENST00000531014 5053 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.242e-7■■□□□ 13.8
ILF3Q12906 CTNND1-218ENST00000528232 5745 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.292e-7■■□□□ 13.8
ILF3Q12906 CTNND1-236ENST00000533667 4990 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.312e-7■■□□□ 13.8
ILF3Q12906 CTNND1-212ENST00000525902 4984 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.342e-7■■□□□ 13.8
ILF3Q12906 CTNND1-214ENST00000526772 4966 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.342e-7■■□□□ 13.8
ILF3Q12906 PHKB-207ENST00000566037 1032 ntTSL 223.24■■□□□ 1.313e-8■■□□□ 13.8
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ILF3Q12906 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 03e-8■■□□□ 13.8
ILF3Q12906 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.133e-8■■□□□ 13.8
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ILF3Q12906 STK40-203ENST00000373130 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.393e-8■■□□□ 13.8
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ILF3Q12906 PHKB-201ENST00000299167 5464 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.233e-8■■□□□ 13.8
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ILF3Q12906 PHKB-205ENST00000564873 1493 ntTSL 33.97□□□□□ -1.773e-8■■□□□ 13.8
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ILF3Q12906 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.042e-6■■□□□ 13.8
ILF3Q12906 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.072e-6■■□□□ 13.8
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ILF3Q12906 FANCA-222ENST00000567205 413 ntTSL 1 (best)16.26■□□□□ 0.193e-7■■□□□ 13.8
ILF3Q12906 DNAJC3-202ENST00000602402 5591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.342e-7■■□□□ 13.8
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ILF3Q12906 SNX25-207ENST00000618785 3151 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.282e-6■■□□□ 13.8
ILF3Q12906 SNX25-202ENST00000504273 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.372e-6■■□□□ 13.8
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ILF3Q12906 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.822e-6■■□□□ 13.7
ILF3Q12906 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.752e-6■■□□□ 13.7
ILF3Q12906 DEDD2-206ENST00000598090 463 ntTSL 319.75■□□□□ 0.752e-6■■□□□ 13.7
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ILF3Q12906 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.622e-6■■□□□ 13.7
ILF3Q12906 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.582e-6■■□□□ 13.7
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ILF3Q12906 DEDD2-213ENST00000602201 556 ntTSL 416.94■□□□□ 0.32e-6■■□□□ 13.7
ILF3Q12906 DEDD2-202ENST00000593561 546 ntTSL 416.84■□□□□ 0.292e-6■■□□□ 13.7
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ILF3Q12906 MALRD1-201ENST00000377265 1761 ntTSL 26.72□□□□□ -1.332e-7■■□□□ 13.7
ILF3Q12906 MALRD1-204ENST00000454679 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.672e-7■■□□□ 13.7
ILF3Q12906 MALRD1-205ENST00000480707 414 ntTSL 34.15□□□□□ -1.752e-7■■□□□ 13.7
ILF3Q12906 MAP4K4-218ENST00000498066 1017 ntTSL 212.3□□□□□ -0.441e-8■■□□□ 13.7
ILF3Q12906 MAP4K4-216ENST00000491743 646 ntTSL 48.22□□□□□ -1.091e-8■■□□□ 13.7
ILF3Q12906 MAP4K4-209ENST00000421882 3416 ntTSL 58.03□□□□□ -1.121e-8■■□□□ 13.7
ILF3Q12906 RSPRY1-208ENST00000564435 743 ntTSL 520.59■□□□□ 0.893e-8■■□□□ 13.7
ILF3Q12906 RSPRY1-206ENST00000562959 548 ntTSL 419.44■□□□□ 0.73e-8■■□□□ 13.7
ILF3Q12906 RSPRY1-204ENST00000562439 692 ntTSL 518.95■□□□□ 0.623e-8■■□□□ 13.7
ILF3Q12906 RSPRY1-211ENST00000568505 654 ntTSL 516.44■□□□□ 0.223e-8■■□□□ 13.7
ILF3Q12906 RSPRY1-203ENST00000561641 579 ntTSL 510.87□□□□□ -0.673e-8■■□□□ 13.7
ILF3Q12906 HNRNPC-231ENST00000557336 580 ntTSL 311.11□□□□□ -0.632e-11■■□□□ 13.7
ILF3Q12906 HNRNPC-233ENST00000557768 599 ntTSL 35.3□□□□□ -1.562e-11■■□□□ 13.7
ILF3Q12906 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.544e-7■■□□□ 13.7
ILF3Q12906 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.474e-7■■□□□ 13.7
ILF3Q12906 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.264e-7■■□□□ 13.7
ILF3Q12906 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.134e-7■■□□□ 13.7
ILF3Q12906 NFYC-209ENST00000424419 1276 ntTSL 220.98■□□□□ 0.954e-7■■□□□ 13.7
ILF3Q12906 NFYC-214ENST00000453631 650 ntTSL 520.41■□□□□ 0.864e-7■■□□□ 13.7
ILF3Q12906 TTC39B-204ENST00000505732 1881 ntTSL 1 (best)19.81■□□□□ 0.764e-7■■□□□ 13.7
ILF3Q12906 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.764e-7■■□□□ 13.7
ILF3Q12906 NFS1-209ENST00000456462 747 ntTSL 519.75■□□□□ 0.754e-7■■□□□ 13.7
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