Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP5DP30049 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP5DP30049 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP5DP30049 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP5DP30049 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP5DP30049 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP5DP30049 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP5DP30049 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP5DP30049 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP5DP30049 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP5DP30049 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP5DP30049 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP5DP30049 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP5DP30049 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP5DP30049 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP5DP30049 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP5DP30049 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP5DP30049 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP5DP30049 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP5DP30049 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP5DP30049 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP5DP30049 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP5DP30049 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP5DP30049 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP5DP30049 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP5DP30049 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP5DP30049 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP5DP30049 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP5DP30049 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP5DP30049 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP5DP30049 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP5DP30049 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP5DP30049 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP5DP30049 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP5DP30049 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP5DP30049 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP5DP30049 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP5DP30049 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP5DP30049 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP5DP30049 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP5DP30049 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP5DP30049 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP5DP30049 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP5DP30049 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP5DP30049 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP5DP30049 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP5DP30049 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP5DP30049 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP5DP30049 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP5DP30049 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP5DP30049 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP5DP30049 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP5DP30049 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP5DP30049 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP5DP30049 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP5DP30049 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP5DP30049 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP5DP30049 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP5DP30049 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP5DP30049 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP5DP30049 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP5DP30049 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP5DP30049 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP5DP30049 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP5DP30049 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP5DP30049 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP5DP30049 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP5DP30049 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP5DP30049 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP5DP30049 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP5DP30049 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP5DP30049 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP5DP30049 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP5DP30049 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP5DP30049 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP5DP30049 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP5DP30049 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP5DP30049 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP5DP30049 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP5DP30049 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP5DP30049 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP5DP30049 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP5DP30049 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP5DP30049 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP5DP30049 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP5DP30049 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP5DP30049 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP5DP30049 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP5DP30049 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP5DP30049 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP5DP30049 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP5DP30049 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP5DP30049 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP5DP30049 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP5DP30049 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP5DP30049 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP5DP30049 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP5DP30049 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP5DP30049 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP5DP30049 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms