Protein–RNA interactions for Protein: P17301

ITGA2, Integrin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA2P17301 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ITGA2P17301 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ITGA2P17301 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ITGA2P17301 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ITGA2P17301 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ITGA2P17301 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA2P17301 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA2P17301 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA2P17301 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA2P17301 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA2P17301 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA2P17301 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA2P17301 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA2P17301 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA2P17301 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA2P17301 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA2P17301 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA2P17301 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA2P17301 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA2P17301 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA2P17301 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA2P17301 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA2P17301 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA2P17301 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA2P17301 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA2P17301 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA2P17301 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA2P17301 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA2P17301 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA2P17301 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA2P17301 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA2P17301 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA2P17301 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA2P17301 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA2P17301 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA2P17301 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA2P17301 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA2P17301 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA2P17301 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA2P17301 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA2P17301 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA2P17301 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA2P17301 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA2P17301 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA2P17301 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA2P17301 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA2P17301 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA2P17301 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA2P17301 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA2P17301 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA2P17301 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA2P17301 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA2P17301 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA2P17301 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA2P17301 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA2P17301 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA2P17301 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA2P17301 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA2P17301 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA2P17301 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA2P17301 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA2P17301 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA2P17301 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA2P17301 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA2P17301 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA2P17301 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA2P17301 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA2P17301 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA2P17301 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA2P17301 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA2P17301 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA2P17301 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA2P17301 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA2P17301 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA2P17301 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA2P17301 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA2P17301 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA2P17301 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA2P17301 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA2P17301 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA2P17301 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA2P17301 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA2P17301 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA2P17301 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA2P17301 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA2P17301 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA2P17301 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA2P17301 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA2P17301 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA2P17301 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA2P17301 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA2P17301 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA2P17301 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA2P17301 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA2P17301 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA2P17301 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA2P17301 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA2P17301 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA2P17301 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA2P17301 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms