Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSB4

ATG101, Autophagy-related protein 101, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG101Q9BSB4 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATG101Q9BSB4 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATG101Q9BSB4 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATG101Q9BSB4 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ATG101Q9BSB4 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATG101Q9BSB4 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATG101Q9BSB4 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATG101Q9BSB4 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATG101Q9BSB4 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATG101Q9BSB4 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATG101Q9BSB4 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATG101Q9BSB4 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATG101Q9BSB4 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATG101Q9BSB4 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATG101Q9BSB4 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATG101Q9BSB4 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATG101Q9BSB4 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATG101Q9BSB4 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATG101Q9BSB4 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATG101Q9BSB4 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATG101Q9BSB4 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATG101Q9BSB4 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATG101Q9BSB4 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATG101Q9BSB4 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATG101Q9BSB4 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATG101Q9BSB4 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATG101Q9BSB4 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATG101Q9BSB4 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATG101Q9BSB4 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATG101Q9BSB4 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
ATG101Q9BSB4 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATG101Q9BSB4 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATG101Q9BSB4 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATG101Q9BSB4 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATG101Q9BSB4 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATG101Q9BSB4 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATG101Q9BSB4 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATG101Q9BSB4 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATG101Q9BSB4 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATG101Q9BSB4 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATG101Q9BSB4 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATG101Q9BSB4 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATG101Q9BSB4 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATG101Q9BSB4 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATG101Q9BSB4 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATG101Q9BSB4 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ATG101Q9BSB4 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ATG101Q9BSB4 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ATG101Q9BSB4 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ATG101Q9BSB4 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ATG101Q9BSB4 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ATG101Q9BSB4 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ATG101Q9BSB4 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ATG101Q9BSB4 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
ATG101Q9BSB4 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ATG101Q9BSB4 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ATG101Q9BSB4 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ATG101Q9BSB4 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ATG101Q9BSB4 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ATG101Q9BSB4 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ATG101Q9BSB4 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ATG101Q9BSB4 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ATG101Q9BSB4 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ATG101Q9BSB4 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ATG101Q9BSB4 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ATG101Q9BSB4 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ATG101Q9BSB4 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
ATG101Q9BSB4 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATG101Q9BSB4 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATG101Q9BSB4 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATG101Q9BSB4 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATG101Q9BSB4 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
ATG101Q9BSB4 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATG101Q9BSB4 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATG101Q9BSB4 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATG101Q9BSB4 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATG101Q9BSB4 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATG101Q9BSB4 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATG101Q9BSB4 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATG101Q9BSB4 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATG101Q9BSB4 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATG101Q9BSB4 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATG101Q9BSB4 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATG101Q9BSB4 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATG101Q9BSB4 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATG101Q9BSB4 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATG101Q9BSB4 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATG101Q9BSB4 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATG101Q9BSB4 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATG101Q9BSB4 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATG101Q9BSB4 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATG101Q9BSB4 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATG101Q9BSB4 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATG101Q9BSB4 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATG101Q9BSB4 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATG101Q9BSB4 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATG101Q9BSB4 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATG101Q9BSB4 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATG101Q9BSB4 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATG101Q9BSB4 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms