Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms