Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms