Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms