Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PEX6Q13608 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PEX6Q13608 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PEX6Q13608 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PEX6Q13608 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PEX6Q13608 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PEX6Q13608 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PEX6Q13608 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PEX6Q13608 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PEX6Q13608 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PEX6Q13608 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PEX6Q13608 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PEX6Q13608 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PEX6Q13608 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PEX6Q13608 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PEX6Q13608 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PEX6Q13608 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PEX6Q13608 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PEX6Q13608 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PEX6Q13608 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PEX6Q13608 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PEX6Q13608 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PEX6Q13608 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PEX6Q13608 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PEX6Q13608 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PEX6Q13608 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PEX6Q13608 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PEX6Q13608 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PEX6Q13608 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PEX6Q13608 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PEX6Q13608 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PEX6Q13608 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PEX6Q13608 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PEX6Q13608 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PEX6Q13608 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PEX6Q13608 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PEX6Q13608 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PEX6Q13608 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PEX6Q13608 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PEX6Q13608 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PEX6Q13608 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PEX6Q13608 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PEX6Q13608 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PEX6Q13608 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PEX6Q13608 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
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PEX6Q13608 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PEX6Q13608 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PEX6Q13608 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PEX6Q13608 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PEX6Q13608 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PEX6Q13608 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PEX6Q13608 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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PEX6Q13608 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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PEX6Q13608 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
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