Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms