Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CRATP43155 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CRATP43155 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CRATP43155 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CRATP43155 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CRATP43155 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CRATP43155 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CRATP43155 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CRATP43155 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CRATP43155 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CRATP43155 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CRATP43155 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CRATP43155 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CRATP43155 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CRATP43155 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CRATP43155 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CRATP43155 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CRATP43155 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CRATP43155 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CRATP43155 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CRATP43155 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CRATP43155 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CRATP43155 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CRATP43155 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CRATP43155 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CRATP43155 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CRATP43155 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CRATP43155 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CRATP43155 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CRATP43155 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CRATP43155 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CRATP43155 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CRATP43155 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CRATP43155 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CRATP43155 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CRATP43155 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CRATP43155 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CRATP43155 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CRATP43155 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CRATP43155 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CRATP43155 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CRATP43155 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CRATP43155 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CRATP43155 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CRATP43155 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CRATP43155 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CRATP43155 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CRATP43155 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CRATP43155 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CRATP43155 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CRATP43155 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CRATP43155 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CRATP43155 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CRATP43155 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CRATP43155 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CRATP43155 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CRATP43155 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CRATP43155 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CRATP43155 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CRATP43155 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CRATP43155 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CRATP43155 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CRATP43155 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CRATP43155 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CRATP43155 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CRATP43155 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CRATP43155 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CRATP43155 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CRATP43155 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CRATP43155 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CRATP43155 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CRATP43155 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CRATP43155 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CRATP43155 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CRATP43155 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CRATP43155 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CRATP43155 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CRATP43155 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CRATP43155 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CRATP43155 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CRATP43155 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CRATP43155 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CRATP43155 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CRATP43155 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CRATP43155 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CRATP43155 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CRATP43155 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CRATP43155 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CRATP43155 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CRATP43155 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CRATP43155 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CRATP43155 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CRATP43155 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CRATP43155 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CRATP43155 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CRATP43155 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CRATP43155 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CRATP43155 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CRATP43155 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CRATP43155 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms