Protein–RNA interactions for Protein: P17252

PRKCA, Protein kinase C alpha type, humanhuman

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCAP17252 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKCAP17252 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms