Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms