Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F3O00716 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F3O00716 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F3O00716 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F3O00716 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F3O00716 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F3O00716 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F3O00716 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F3O00716 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F3O00716 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F3O00716 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F3O00716 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F3O00716 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F3O00716 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F3O00716 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F3O00716 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F3O00716 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F3O00716 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F3O00716 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F3O00716 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F3O00716 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F3O00716 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F3O00716 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F3O00716 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F3O00716 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F3O00716 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F3O00716 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F3O00716 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F3O00716 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F3O00716 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F3O00716 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F3O00716 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F3O00716 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F3O00716 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F3O00716 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F3O00716 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F3O00716 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F3O00716 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F3O00716 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F3O00716 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F3O00716 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F3O00716 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F3O00716 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F3O00716 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F3O00716 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F3O00716 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F3O00716 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F3O00716 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F3O00716 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F3O00716 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F3O00716 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F3O00716 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F3O00716 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F3O00716 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F3O00716 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F3O00716 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F3O00716 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F3O00716 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F3O00716 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F3O00716 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F3O00716 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F3O00716 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F3O00716 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F3O00716 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F3O00716 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F3O00716 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F3O00716 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F3O00716 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F3O00716 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F3O00716 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F3O00716 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F3O00716 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F3O00716 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F3O00716 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F3O00716 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F3O00716 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F3O00716 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F3O00716 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F3O00716 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F3O00716 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F3O00716 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F3O00716 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F3O00716 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F3O00716 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F3O00716 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F3O00716 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F3O00716 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
E2F3O00716 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
E2F3O00716 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
E2F3O00716 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
E2F3O00716 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
E2F3O00716 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
E2F3O00716 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
E2F3O00716 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
E2F3O00716 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
E2F3O00716 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
E2F3O00716 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
E2F3O00716 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
E2F3O00716 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
E2F3O00716 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms