Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms