Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR0

KLHL11, Kelch-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL11Q9NVR0 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL11Q9NVR0 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL11Q9NVR0 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL11Q9NVR0 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL11Q9NVR0 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL11Q9NVR0 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL11Q9NVR0 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL11Q9NVR0 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL11Q9NVR0 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL11Q9NVR0 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL11Q9NVR0 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL11Q9NVR0 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL11Q9NVR0 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL11Q9NVR0 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL11Q9NVR0 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL11Q9NVR0 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL11Q9NVR0 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL11Q9NVR0 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL11Q9NVR0 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL11Q9NVR0 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL11Q9NVR0 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL11Q9NVR0 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL11Q9NVR0 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL11Q9NVR0 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL11Q9NVR0 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL11Q9NVR0 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
KLHL11Q9NVR0 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
KLHL11Q9NVR0 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
KLHL11Q9NVR0 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
KLHL11Q9NVR0 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL11Q9NVR0 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL11Q9NVR0 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL11Q9NVR0 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL11Q9NVR0 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL11Q9NVR0 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL11Q9NVR0 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL11Q9NVR0 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL11Q9NVR0 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL11Q9NVR0 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL11Q9NVR0 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL11Q9NVR0 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL11Q9NVR0 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL11Q9NVR0 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL11Q9NVR0 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL11Q9NVR0 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL11Q9NVR0 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL11Q9NVR0 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL11Q9NVR0 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL11Q9NVR0 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL11Q9NVR0 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL11Q9NVR0 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL11Q9NVR0 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL11Q9NVR0 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL11Q9NVR0 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL11Q9NVR0 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL11Q9NVR0 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL11Q9NVR0 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL11Q9NVR0 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL11Q9NVR0 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL11Q9NVR0 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL11Q9NVR0 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL11Q9NVR0 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL11Q9NVR0 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL11Q9NVR0 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL11Q9NVR0 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL11Q9NVR0 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL11Q9NVR0 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL11Q9NVR0 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL11Q9NVR0 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL11Q9NVR0 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL11Q9NVR0 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL11Q9NVR0 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL11Q9NVR0 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL11Q9NVR0 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL11Q9NVR0 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL11Q9NVR0 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL11Q9NVR0 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL11Q9NVR0 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL11Q9NVR0 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL11Q9NVR0 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL11Q9NVR0 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL11Q9NVR0 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL11Q9NVR0 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL11Q9NVR0 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL11Q9NVR0 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL11Q9NVR0 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL11Q9NVR0 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL11Q9NVR0 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL11Q9NVR0 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL11Q9NVR0 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL11Q9NVR0 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL11Q9NVR0 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL11Q9NVR0 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL11Q9NVR0 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL11Q9NVR0 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL11Q9NVR0 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL11Q9NVR0 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL11Q9NVR0 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL11Q9NVR0 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL11Q9NVR0 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms