Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR00

C8orf4, Protein C8orf4, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf4Q9NR00 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
C8orf4Q9NR00 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
C8orf4Q9NR00 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
C8orf4Q9NR00 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
C8orf4Q9NR00 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C8orf4Q9NR00 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C8orf4Q9NR00 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C8orf4Q9NR00 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C8orf4Q9NR00 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C8orf4Q9NR00 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C8orf4Q9NR00 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C8orf4Q9NR00 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C8orf4Q9NR00 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C8orf4Q9NR00 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C8orf4Q9NR00 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C8orf4Q9NR00 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C8orf4Q9NR00 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C8orf4Q9NR00 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C8orf4Q9NR00 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C8orf4Q9NR00 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C8orf4Q9NR00 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C8orf4Q9NR00 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C8orf4Q9NR00 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C8orf4Q9NR00 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C8orf4Q9NR00 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C8orf4Q9NR00 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C8orf4Q9NR00 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C8orf4Q9NR00 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C8orf4Q9NR00 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C8orf4Q9NR00 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C8orf4Q9NR00 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C8orf4Q9NR00 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C8orf4Q9NR00 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C8orf4Q9NR00 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C8orf4Q9NR00 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C8orf4Q9NR00 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C8orf4Q9NR00 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms