Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms