Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB30

CSAG1, Putative chondrosarcoma-associated gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1Q6PB30 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC9.56□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms