Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT2

H3F3C, Histone H3.3C, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3CQ6NXT2 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
H3F3CQ6NXT2 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
H3F3CQ6NXT2 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H3F3CQ6NXT2 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H3F3CQ6NXT2 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H3F3CQ6NXT2 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
H3F3CQ6NXT2 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
H3F3CQ6NXT2 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
H3F3CQ6NXT2 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H3F3CQ6NXT2 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H3F3CQ6NXT2 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
H3F3CQ6NXT2 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
H3F3CQ6NXT2 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
H3F3CQ6NXT2 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
H3F3CQ6NXT2 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H3F3CQ6NXT2 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H3F3CQ6NXT2 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
H3F3CQ6NXT2 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
H3F3CQ6NXT2 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H3F3CQ6NXT2 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H3F3CQ6NXT2 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
H3F3CQ6NXT2 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
H3F3CQ6NXT2 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
H3F3CQ6NXT2 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H3F3CQ6NXT2 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
H3F3CQ6NXT2 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
H3F3CQ6NXT2 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms