Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms