Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TTF1Q15361 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TTF1Q15361 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TTF1Q15361 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTF1Q15361 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTF1Q15361 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTF1Q15361 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTF1Q15361 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTF1Q15361 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTF1Q15361 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TTF1Q15361 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTF1Q15361 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTF1Q15361 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTF1Q15361 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTF1Q15361 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTF1Q15361 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTF1Q15361 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTF1Q15361 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTF1Q15361 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTF1Q15361 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TTF1Q15361 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTF1Q15361 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTF1Q15361 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTF1Q15361 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTF1Q15361 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTF1Q15361 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTF1Q15361 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTF1Q15361 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTF1Q15361 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTF1Q15361 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
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