Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1CQ13936 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms