Protein–RNA interactions for Protein: P39900

MMP12, Macrophage metalloelastase, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP12P39900 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MMP12P39900 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MMP12P39900 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MMP12P39900 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MMP12P39900 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MMP12P39900 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MMP12P39900 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MMP12P39900 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MMP12P39900 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MMP12P39900 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MMP12P39900 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MMP12P39900 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MMP12P39900 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MMP12P39900 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MMP12P39900 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MMP12P39900 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MMP12P39900 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MMP12P39900 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MMP12P39900 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MMP12P39900 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MMP12P39900 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MMP12P39900 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MMP12P39900 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MMP12P39900 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MMP12P39900 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MMP12P39900 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MMP12P39900 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MMP12P39900 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MMP12P39900 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MMP12P39900 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MMP12P39900 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MMP12P39900 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MMP12P39900 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MMP12P39900 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MMP12P39900 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MMP12P39900 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MMP12P39900 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MMP12P39900 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MMP12P39900 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MMP12P39900 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MMP12P39900 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MMP12P39900 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MMP12P39900 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MMP12P39900 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MMP12P39900 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MMP12P39900 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MMP12P39900 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MMP12P39900 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MMP12P39900 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MMP12P39900 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MMP12P39900 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MMP12P39900 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MMP12P39900 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MMP12P39900 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MMP12P39900 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MMP12P39900 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MMP12P39900 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MMP12P39900 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MMP12P39900 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MMP12P39900 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MMP12P39900 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MMP12P39900 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MMP12P39900 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MMP12P39900 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MMP12P39900 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MMP12P39900 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MMP12P39900 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MMP12P39900 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MMP12P39900 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MMP12P39900 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MMP12P39900 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MMP12P39900 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MMP12P39900 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MMP12P39900 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MMP12P39900 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MMP12P39900 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MMP12P39900 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MMP12P39900 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MMP12P39900 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MMP12P39900 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MMP12P39900 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MMP12P39900 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MMP12P39900 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MMP12P39900 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MMP12P39900 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MMP12P39900 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MMP12P39900 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MMP12P39900 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MMP12P39900 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MMP12P39900 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MMP12P39900 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MMP12P39900 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MMP12P39900 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MMP12P39900 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MMP12P39900 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MMP12P39900 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MMP12P39900 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MMP12P39900 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MMP12P39900 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MMP12P39900 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms