Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms