Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATP9BO43861 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATP9BO43861 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATP9BO43861 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP9BO43861 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP9BO43861 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP9BO43861 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP9BO43861 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP9BO43861 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP9BO43861 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP9BO43861 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP9BO43861 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP9BO43861 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP9BO43861 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP9BO43861 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP9BO43861 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP9BO43861 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP9BO43861 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP9BO43861 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP9BO43861 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP9BO43861 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP9BO43861 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP9BO43861 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP9BO43861 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP9BO43861 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP9BO43861 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP9BO43861 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP9BO43861 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP9BO43861 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP9BO43861 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP9BO43861 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP9BO43861 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP9BO43861 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP9BO43861 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP9BO43861 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP9BO43861 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP9BO43861 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP9BO43861 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP9BO43861 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP9BO43861 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP9BO43861 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP9BO43861 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP9BO43861 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP9BO43861 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP9BO43861 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP9BO43861 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP9BO43861 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP9BO43861 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP9BO43861 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP9BO43861 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP9BO43861 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP9BO43861 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP9BO43861 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP9BO43861 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP9BO43861 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP9BO43861 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP9BO43861 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP9BO43861 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP9BO43861 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP9BO43861 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP9BO43861 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP9BO43861 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP9BO43861 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP9BO43861 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP9BO43861 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP9BO43861 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP9BO43861 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP9BO43861 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP9BO43861 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP9BO43861 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP9BO43861 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP9BO43861 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP9BO43861 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP9BO43861 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP9BO43861 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP9BO43861 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP9BO43861 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP9BO43861 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP9BO43861 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP9BO43861 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP9BO43861 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP9BO43861 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP9BO43861 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP9BO43861 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP9BO43861 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP9BO43861 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP9BO43861 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP9BO43861 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP9BO43861 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP9BO43861 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP9BO43861 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP9BO43861 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP9BO43861 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP9BO43861 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP9BO43861 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP9BO43861 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP9BO43861 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP9BO43861 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP9BO43861 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP9BO43861 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms