Protein–RNA interactions for Protein: O00468

AGRN, Agrin, humanhuman

Predictions only

Length 2,067 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRNO00468 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
AGRNO00468 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
AGRNO00468 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
AGRNO00468 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
AGRNO00468 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
AGRNO00468 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
AGRNO00468 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
AGRNO00468 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
AGRNO00468 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
AGRNO00468 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
AGRNO00468 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
AGRNO00468 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
AGRNO00468 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
AGRNO00468 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
AGRNO00468 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
AGRNO00468 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
AGRNO00468 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
AGRNO00468 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
AGRNO00468 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
AGRNO00468 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
AGRNO00468 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
AGRNO00468 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
AGRNO00468 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
AGRNO00468 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
AGRNO00468 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
AGRNO00468 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
AGRNO00468 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
AGRNO00468 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
AGRNO00468 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
AGRNO00468 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
AGRNO00468 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
AGRNO00468 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
AGRNO00468 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
AGRNO00468 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
AGRNO00468 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
AGRNO00468 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
AGRNO00468 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
AGRNO00468 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
AGRNO00468 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
AGRNO00468 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
AGRNO00468 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AGRNO00468 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
AGRNO00468 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
AGRNO00468 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
AGRNO00468 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
AGRNO00468 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AGRNO00468 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AGRNO00468 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
AGRNO00468 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
AGRNO00468 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AGRNO00468 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
AGRNO00468 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AGRNO00468 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AGRNO00468 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AGRNO00468 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AGRNO00468 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AGRNO00468 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
AGRNO00468 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
AGRNO00468 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
AGRNO00468 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AGRNO00468 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
AGRNO00468 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
AGRNO00468 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
AGRNO00468 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
AGRNO00468 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
AGRNO00468 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
AGRNO00468 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
AGRNO00468 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AGRNO00468 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
AGRNO00468 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AGRNO00468 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
AGRNO00468 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
AGRNO00468 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
AGRNO00468 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
AGRNO00468 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
AGRNO00468 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AGRNO00468 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AGRNO00468 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
AGRNO00468 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AGRNO00468 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AGRNO00468 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AGRNO00468 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
AGRNO00468 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
AGRNO00468 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
AGRNO00468 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
AGRNO00468 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
AGRNO00468 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AGRNO00468 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
AGRNO00468 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AGRNO00468 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AGRNO00468 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
AGRNO00468 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
AGRNO00468 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AGRNO00468 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AGRNO00468 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AGRNO00468 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
AGRNO00468 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
AGRNO00468 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AGRNO00468 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
AGRNO00468 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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