Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms