Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RABGEF1Q9UJ41 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RABGEF1Q9UJ41 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RABGEF1Q9UJ41 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RABGEF1Q9UJ41 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RABGEF1Q9UJ41 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RABGEF1Q9UJ41 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RABGEF1Q9UJ41 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RABGEF1Q9UJ41 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RABGEF1Q9UJ41 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RABGEF1Q9UJ41 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RABGEF1Q9UJ41 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RABGEF1Q9UJ41 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RABGEF1Q9UJ41 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RABGEF1Q9UJ41 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RABGEF1Q9UJ41 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RABGEF1Q9UJ41 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RABGEF1Q9UJ41 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RABGEF1Q9UJ41 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RABGEF1Q9UJ41 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RABGEF1Q9UJ41 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RABGEF1Q9UJ41 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RABGEF1Q9UJ41 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RABGEF1Q9UJ41 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RABGEF1Q9UJ41 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RABGEF1Q9UJ41 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RABGEF1Q9UJ41 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RABGEF1Q9UJ41 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RABGEF1Q9UJ41 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RABGEF1Q9UJ41 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RABGEF1Q9UJ41 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RABGEF1Q9UJ41 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RABGEF1Q9UJ41 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RABGEF1Q9UJ41 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RABGEF1Q9UJ41 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RABGEF1Q9UJ41 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RABGEF1Q9UJ41 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RABGEF1Q9UJ41 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RABGEF1Q9UJ41 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RABGEF1Q9UJ41 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RABGEF1Q9UJ41 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RABGEF1Q9UJ41 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RABGEF1Q9UJ41 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RABGEF1Q9UJ41 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RABGEF1Q9UJ41 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RABGEF1Q9UJ41 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RABGEF1Q9UJ41 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RABGEF1Q9UJ41 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RABGEF1Q9UJ41 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RABGEF1Q9UJ41 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RABGEF1Q9UJ41 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RABGEF1Q9UJ41 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
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RABGEF1Q9UJ41 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
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RABGEF1Q9UJ41 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RABGEF1Q9UJ41 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RABGEF1Q9UJ41 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RABGEF1Q9UJ41 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RABGEF1Q9UJ41 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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RABGEF1Q9UJ41 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RABGEF1Q9UJ41 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RABGEF1Q9UJ41 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
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RABGEF1Q9UJ41 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
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RABGEF1Q9UJ41 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
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RABGEF1Q9UJ41 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
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