Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSI8

SAMSN1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMSN1Q9NSI8 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SAMSN1Q9NSI8 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SAMSN1Q9NSI8 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SAMSN1Q9NSI8 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SAMSN1Q9NSI8 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SAMSN1Q9NSI8 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SAMSN1Q9NSI8 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SAMSN1Q9NSI8 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SAMSN1Q9NSI8 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SAMSN1Q9NSI8 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SAMSN1Q9NSI8 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SAMSN1Q9NSI8 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SAMSN1Q9NSI8 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SAMSN1Q9NSI8 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SAMSN1Q9NSI8 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SAMSN1Q9NSI8 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SAMSN1Q9NSI8 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SAMSN1Q9NSI8 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SAMSN1Q9NSI8 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SAMSN1Q9NSI8 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SAMSN1Q9NSI8 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SAMSN1Q9NSI8 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SAMSN1Q9NSI8 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SAMSN1Q9NSI8 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SAMSN1Q9NSI8 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SAMSN1Q9NSI8 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SAMSN1Q9NSI8 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SAMSN1Q9NSI8 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SAMSN1Q9NSI8 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SAMSN1Q9NSI8 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SAMSN1Q9NSI8 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SAMSN1Q9NSI8 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SAMSN1Q9NSI8 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SAMSN1Q9NSI8 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SAMSN1Q9NSI8 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SAMSN1Q9NSI8 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SAMSN1Q9NSI8 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SAMSN1Q9NSI8 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SAMSN1Q9NSI8 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SAMSN1Q9NSI8 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SAMSN1Q9NSI8 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SAMSN1Q9NSI8 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SAMSN1Q9NSI8 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SAMSN1Q9NSI8 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SAMSN1Q9NSI8 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SAMSN1Q9NSI8 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SAMSN1Q9NSI8 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SAMSN1Q9NSI8 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SAMSN1Q9NSI8 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SAMSN1Q9NSI8 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SAMSN1Q9NSI8 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SAMSN1Q9NSI8 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SAMSN1Q9NSI8 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SAMSN1Q9NSI8 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SAMSN1Q9NSI8 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SAMSN1Q9NSI8 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SAMSN1Q9NSI8 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SAMSN1Q9NSI8 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SAMSN1Q9NSI8 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SAMSN1Q9NSI8 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SAMSN1Q9NSI8 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SAMSN1Q9NSI8 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SAMSN1Q9NSI8 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SAMSN1Q9NSI8 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SAMSN1Q9NSI8 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SAMSN1Q9NSI8 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SAMSN1Q9NSI8 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SAMSN1Q9NSI8 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SAMSN1Q9NSI8 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SAMSN1Q9NSI8 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SAMSN1Q9NSI8 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SAMSN1Q9NSI8 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SAMSN1Q9NSI8 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SAMSN1Q9NSI8 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SAMSN1Q9NSI8 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SAMSN1Q9NSI8 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SAMSN1Q9NSI8 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SAMSN1Q9NSI8 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SAMSN1Q9NSI8 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SAMSN1Q9NSI8 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SAMSN1Q9NSI8 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SAMSN1Q9NSI8 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SAMSN1Q9NSI8 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SAMSN1Q9NSI8 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SAMSN1Q9NSI8 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SAMSN1Q9NSI8 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SAMSN1Q9NSI8 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SAMSN1Q9NSI8 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SAMSN1Q9NSI8 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SAMSN1Q9NSI8 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SAMSN1Q9NSI8 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SAMSN1Q9NSI8 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SAMSN1Q9NSI8 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SAMSN1Q9NSI8 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SAMSN1Q9NSI8 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SAMSN1Q9NSI8 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SAMSN1Q9NSI8 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms