Protein–RNA interactions for Protein: Q9H446

RWDD1, RWD domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD1Q9H446 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RWDD1Q9H446 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RWDD1Q9H446 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RWDD1Q9H446 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RWDD1Q9H446 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RWDD1Q9H446 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RWDD1Q9H446 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RWDD1Q9H446 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RWDD1Q9H446 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RWDD1Q9H446 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RWDD1Q9H446 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RWDD1Q9H446 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RWDD1Q9H446 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RWDD1Q9H446 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RWDD1Q9H446 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RWDD1Q9H446 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RWDD1Q9H446 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RWDD1Q9H446 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RWDD1Q9H446 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RWDD1Q9H446 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RWDD1Q9H446 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RWDD1Q9H446 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RWDD1Q9H446 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RWDD1Q9H446 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RWDD1Q9H446 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RWDD1Q9H446 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RWDD1Q9H446 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RWDD1Q9H446 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RWDD1Q9H446 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RWDD1Q9H446 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RWDD1Q9H446 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RWDD1Q9H446 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RWDD1Q9H446 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RWDD1Q9H446 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RWDD1Q9H446 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RWDD1Q9H446 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RWDD1Q9H446 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RWDD1Q9H446 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RWDD1Q9H446 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RWDD1Q9H446 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RWDD1Q9H446 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RWDD1Q9H446 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RWDD1Q9H446 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RWDD1Q9H446 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RWDD1Q9H446 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RWDD1Q9H446 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RWDD1Q9H446 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RWDD1Q9H446 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RWDD1Q9H446 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RWDD1Q9H446 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RWDD1Q9H446 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RWDD1Q9H446 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RWDD1Q9H446 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RWDD1Q9H446 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RWDD1Q9H446 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RWDD1Q9H446 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RWDD1Q9H446 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RWDD1Q9H446 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RWDD1Q9H446 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RWDD1Q9H446 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RWDD1Q9H446 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RWDD1Q9H446 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RWDD1Q9H446 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RWDD1Q9H446 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RWDD1Q9H446 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RWDD1Q9H446 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RWDD1Q9H446 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RWDD1Q9H446 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RWDD1Q9H446 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RWDD1Q9H446 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RWDD1Q9H446 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RWDD1Q9H446 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RWDD1Q9H446 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RWDD1Q9H446 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RWDD1Q9H446 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RWDD1Q9H446 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RWDD1Q9H446 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RWDD1Q9H446 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RWDD1Q9H446 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RWDD1Q9H446 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RWDD1Q9H446 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RWDD1Q9H446 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RWDD1Q9H446 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RWDD1Q9H446 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RWDD1Q9H446 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RWDD1Q9H446 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RWDD1Q9H446 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RWDD1Q9H446 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RWDD1Q9H446 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RWDD1Q9H446 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RWDD1Q9H446 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RWDD1Q9H446 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RWDD1Q9H446 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RWDD1Q9H446 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RWDD1Q9H446 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RWDD1Q9H446 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RWDD1Q9H446 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RWDD1Q9H446 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RWDD1Q9H446 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RWDD1Q9H446 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms