Protein–RNA interactions for Protein: Q99856

ARID3A, AT-rich interactive domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3AQ99856 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ARID3AQ99856 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ARID3AQ99856 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ARID3AQ99856 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ARID3AQ99856 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms