Protein–RNA interactions for Protein: Q16515

ASIC2, Acid-sensing ion channel 2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC2Q16515 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ASIC2Q16515 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ASIC2Q16515 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ASIC2Q16515 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ASIC2Q16515 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ASIC2Q16515 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ASIC2Q16515 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ASIC2Q16515 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ASIC2Q16515 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ASIC2Q16515 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ASIC2Q16515 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ASIC2Q16515 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ASIC2Q16515 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ASIC2Q16515 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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