Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms