Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

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Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEMA3FQ13275 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEMA3FQ13275 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SEMA3FQ13275 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEMA3FQ13275 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEMA3FQ13275 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEMA3FQ13275 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEMA3FQ13275 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEMA3FQ13275 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEMA3FQ13275 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEMA3FQ13275 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEMA3FQ13275 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMA3FQ13275 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMA3FQ13275 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMA3FQ13275 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMA3FQ13275 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMA3FQ13275 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMA3FQ13275 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMA3FQ13275 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMA3FQ13275 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMA3FQ13275 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMA3FQ13275 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMA3FQ13275 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMA3FQ13275 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMA3FQ13275 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMA3FQ13275 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMA3FQ13275 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMA3FQ13275 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMA3FQ13275 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMA3FQ13275 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMA3FQ13275 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMA3FQ13275 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMA3FQ13275 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMA3FQ13275 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA3FQ13275 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA3FQ13275 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA3FQ13275 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA3FQ13275 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA3FQ13275 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA3FQ13275 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA3FQ13275 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA3FQ13275 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA3FQ13275 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA3FQ13275 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA3FQ13275 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA3FQ13275 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA3FQ13275 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA3FQ13275 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA3FQ13275 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA3FQ13275 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA3FQ13275 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA3FQ13275 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA3FQ13275 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA3FQ13275 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA3FQ13275 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA3FQ13275 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA3FQ13275 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA3FQ13275 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA3FQ13275 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA3FQ13275 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA3FQ13275 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA3FQ13275 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA3FQ13275 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA3FQ13275 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA3FQ13275 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA3FQ13275 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA3FQ13275 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SEMA3FQ13275 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SEMA3FQ13275 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SEMA3FQ13275 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SEMA3FQ13275 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SEMA3FQ13275 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEMA3FQ13275 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEMA3FQ13275 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEMA3FQ13275 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEMA3FQ13275 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEMA3FQ13275 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SEMA3FQ13275 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEMA3FQ13275 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEMA3FQ13275 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEMA3FQ13275 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEMA3FQ13275 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEMA3FQ13275 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEMA3FQ13275 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEMA3FQ13275 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEMA3FQ13275 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEMA3FQ13275 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMA3FQ13275 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMA3FQ13275 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMA3FQ13275 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMA3FQ13275 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMA3FQ13275 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMA3FQ13275 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMA3FQ13275 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMA3FQ13275 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMA3FQ13275 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMA3FQ13275 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMA3FQ13275 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMA3FQ13275 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMA3FQ13275 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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