Protein–RNA interactions for Protein: P61018

RAB4B, Ras-related protein Rab-4B, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4BP61018 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB4BP61018 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB4BP61018 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB4BP61018 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB4BP61018 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB4BP61018 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB4BP61018 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB4BP61018 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB4BP61018 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB4BP61018 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB4BP61018 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB4BP61018 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB4BP61018 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB4BP61018 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB4BP61018 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB4BP61018 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB4BP61018 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB4BP61018 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB4BP61018 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB4BP61018 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB4BP61018 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB4BP61018 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB4BP61018 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB4BP61018 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB4BP61018 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB4BP61018 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB4BP61018 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB4BP61018 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB4BP61018 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB4BP61018 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB4BP61018 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB4BP61018 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB4BP61018 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB4BP61018 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB4BP61018 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB4BP61018 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB4BP61018 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB4BP61018 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB4BP61018 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB4BP61018 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB4BP61018 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB4BP61018 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB4BP61018 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB4BP61018 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB4BP61018 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB4BP61018 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB4BP61018 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB4BP61018 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB4BP61018 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB4BP61018 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB4BP61018 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB4BP61018 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB4BP61018 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB4BP61018 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB4BP61018 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB4BP61018 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB4BP61018 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB4BP61018 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB4BP61018 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB4BP61018 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB4BP61018 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB4BP61018 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB4BP61018 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB4BP61018 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB4BP61018 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB4BP61018 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB4BP61018 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB4BP61018 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB4BP61018 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB4BP61018 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB4BP61018 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB4BP61018 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB4BP61018 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB4BP61018 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB4BP61018 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB4BP61018 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB4BP61018 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB4BP61018 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB4BP61018 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB4BP61018 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB4BP61018 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB4BP61018 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB4BP61018 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB4BP61018 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB4BP61018 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB4BP61018 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB4BP61018 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB4BP61018 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB4BP61018 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB4BP61018 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB4BP61018 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB4BP61018 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB4BP61018 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB4BP61018 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB4BP61018 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB4BP61018 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB4BP61018 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB4BP61018 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB4BP61018 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB4BP61018 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 154.8 ms