Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC12□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC11.99□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC11.98□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC11.98□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms