Protein–RNA interactions for Protein: O15160

POLR1C, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1CO15160 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms